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====== Trabajos realizados en el clúster de la Universidad de Oriente ======

Los trabajos realizados por los usuarios en el HPC UO han tenido como resultado publicaciones, presentaciones en eventos, trabajos de doctorados, tesis de maestría y trabajos de diploma. Los mismos se relacionan a continuación, desde el año 2015 hasta el presente.

===== Publicaciones =====

Fernández-Gamboa, J.R., Tielens, Frederik, Zulueta, Yohandys A. (2022). **Theoretical study of Li<sub>2</sub>Ti<sub>6</sub>O<sub>13</sub>, Li<sub>2</sub>Sn<sub>6</sub>O<sub>13</sub> and Li<sub>2</sub>Zr<sub>6</sub>O<sub>13</sub> as possible cathode in Li-ion batteries**. Materials Science in Semiconductor Processing. Volume 152, 107074. https://doi.org/10.1016/j.mssp.2022.107074

Rojas-Vargas, J.A.  et-al. (2022). **Chemical Composition and In Vitro and In Silico Antileishmanial Evaluation of the Essential Oil from Croton linearis Jacq. Stems**. Antibiotics, 11, 1712. https://doi.org/10.3390/antibiotics11121712.

Rojas-Vargas, J.A. et-al. (2022). **Acoplamiento molecular de la interacción de imidazoles 4,5-fenil y 4,5-furilsustituidos con enzimas Cyp51 de T. Cruzi, T. Brucei y L. Infantum**. Rev. Cubana Quím. 34(1). e-ISSN: 2224-5421.

Milanes-Hermosilla, Daily  et-al (2021). **Monte Carlo Dropout for Uncertainty Estimation and Motor Imagery Classification**. Sensors, 21, 241. DOI 10.3390/s21217241

Milanes-Hermosilla, Daily  et-al (2021). **Shallow Convolutional Network Excel for Classifying Motor Imagery EEG in BCI Applications**. IEEE Access, Vol 9. DOI 10.1109/ACCESS.2021.3091399

Rojas Vargas, Julio A. et-al (2021). **In Vitro Evaluation and Molecular Docking Studies of Aryl Substituted Imidazoles against Leishmania Amazonensis**. Int. Journal Tropical Diseases, 4:050. DOI 10.23937/2643-461X/1710050

Pelaez, E., Soutelo, A. A. et-al (2021). **Quantum mechanics descriptors in a nano-QSAR model to predict metal oxide nanoparticles toxicity in human keratinous cells**. J. Nanoparticles Research, 23:161. DOI 10.1007/s11051-021-05288-0

Mederos-Núñez, Y., García-López, A., Arada-Pérez, M. (2021) **Selectividad teórica de la  N,N'-%%((1,3-fenilenbis(azanediil))%%bis(carbonotioil))bis(furan-2carboxamida) como ionóforo de electrodo selectivo a iones Plomo(II)**. Rev. Cubana Quím., 33(2), ISSN: 2224-5421.

Beltrán Delgado, Y., Rojas Vargas, J., Morales González, I., Morris Quevedo, H. (2021). **Evaluación in silico del efecto de compuestos fenólicos de Pleurotus ostreatus sobre la enzima 5-lipoxigenasa (5- LOX)**. Revista Cubana de Investigaciones Biomédicas, 40(5), e678.

Otero-Calvis, A., Ramírez-Serrano, B., Coello-Velázquez, A. (2020). **Selectivity in the flotation of copper with xanthate over other ions present in wastewater: An experimental and computational study**. Journal of Molecular Graphics and Modelling, 98, 107587.

Zulueta, Y. A.; Nguyen, M. T.; Dawson, J. A. (2020). **Boosting Li-Ion Transport in Transition-Metal-Doped Li2SnO3**. Inorg. Chem., 59 (16), 11841–11846.

Rodríguez Pérez, J. (2020). **Coastal hydrodynamics during Hurricane Wilma in Artemisa, Mayabeque and Havana**. Ing. Hidráulica y Ambient. 41, 3-17.

Valdés Díaz, B., Artigas Fuentes, F.J.  (2020). **Biblioteca en C++  para el trabajo con //clusters//**. Revista Cubana de Ciencias Informáticas. 14(2). ISSN: 2227-1899.

Suarez-León A., Nuñez, J.  (2019). **1D Convolutional Neural Network for Detecting Ventricular Heartbeats**, IEEE Latin America Transactions, Vol. 17, No. 12, pp. 1961-1968, ISSN: 1548-0992, INSPEC Accession Number:  19445533, DOI:  10.1109/TLA.2019.9011541.

López D., Arco L. (2019). **Multi-domain Aspect Extraction Based on Deep and Lifelong Learning**. In: Nyström I., Hernández Heredia Y., Milián Núñez V. (eds) Progress in Pattern Recognition, Image Analysis, Computer Vision, and Applications. CIARP 2019. Lecture Notes in Computer Science, vol 11896. Springer, Cham. https://doi.org/10.1007/978-3-030-33904-3_52. 

Aldana, Y. R., Macías, F. S., Reyes, E. J. M., Rodríguez, V. R., Van Huffel, S., Hunyadi, B. (2019). **Using Partial Least Squares for Nonconvulsive Epileptic Seizure Detection**. Revista Cubana de Ciencias Informáticas, 13(1), 1-13.

González Rubio, T., Drullet Ferrer, J.L., Rodríguez Aldana, Y., Marañón Reyes, E. J., Montoya Pedrón, A. (2019). **Propuesta para la monitorización de estados de sedación en señales electroencefalográficas**. Revista Ingeniería Electrónica, Automática y Comunicaciones. Vol. 40, Num. 3.

González Rubio, T., Rodríguez Aldana, Y., Drullet Ferrer, J. L., Marañón Reyes, E. J., Montoya Pedrón, A. (2019). **Monitorización automática de estados de sedación en señales electroencefalográficas**. Revista Cubana de Informática Médica, 19(1), 18-32.

Aldana, Y. R., Reyes, E. J. M., Macías, F. S., Rodríguez, V. R., Chacón, L. M., Van Huffel, S., Hunyadi, B. (2019). **Nonconvulsive epileptic seizure monitoring with incremental learning**. Computers in Biology and Medicine, 114, 103434.

Aldana, Y. R., Hunyadi, B., Reyes, E. J. M., Rodríguez, V. R., & Van Huffel, S. (2019).  **Nonconvulsive Epileptic Seizure Detection in Scalp EEG Using Multiway Data Analysis**. IEEE journal of biomedical and health informatics, 23(2), 660-671.

Artigas-Fuentes, J.F., Badía-Contelles, J.M.  (2017). **Accessing Very High Dimensional Spaces in Parallel**.  Journal of Supercomputing. núm 1, vol. 73.

===== Presentaciones en Eventos =====

Fernández-Gamboa, J.R. (2022). **Theoritical Study of Li<sub>2</sub>Ti<sub>6</sub>O<sub>13</sub>, Li<sub>2</sub>Sn<sub>6</sub>O<sub>13</sub> and Li<sub>2</sub>Zr<sub>6</sub>O<sub>13</sub> as possible cathode in Li-ion batteries**. 19th International Conference on Density Funcional Theory and its Appliacations.Vrije Universiteit Brussel.

Mederos, J. (2020). **Relación entre energías de unión de complejos metal-ionóforos sulfurados calculadas por DFT y coeficientes de selectividad experimentales**. 23 Conferencia de Química.

Portales, E., Mederos, J. (2020). **Estudio teórico de solubilidad y acoplamiento molecular de pseudopéptidos imidazólicos frente a proteínas de Leishmania spp**. 23 Conferencia de Química.

Bergues Morales, L., Soutelo Jiménez, A.A. (2020). **Obtención de modelos QSAR para la predicción de actividad antibacteriana contra Staphilococcus aureus**. 23 Conferencia de Química.

Au Alvarez, O., Díaz Conde, E.E. (2020). **Softwares para renderizar en el HPC de la Universidad de Oriente**.  VI Simposio Nacional INFODISK 2020 

Díaz Conde, E., Au Alvarez, O. (2019). **Instalación de software científico en el HPC de la Universidad de Oriente**.  SIGESTIC´2019.

Artigas Fuentes, F.J., Au Alvarez, O. (2018). **Computación de altas prestaciones para Químicos**. Simposio Internacional de Química.

González Rubio T., Marañón, E.J. (2018). **Máquinas de aprendizaje aplicadas al reconocimiento de estados de sedación en señales electroencefalográficas**. RECPAT 2018.

Rodríguez Pérez, J. (2918), **State of the Art on models for Hydrodyamic Simulation**. Conferencia de Manejo Integrado Costero UNAM, Mexico.

Artigas Fuentes, F.J. (2017). **Computación de altas prestaciones para Químicos**. 22 Conferencia de Química.

Valdés Díaz, B., Au Alvarez, O., Artigas, F.J. (2017). **Portal Web para el clúster de la Universidad de Oriente**. COMPUMAT 2017.

Díaz Conde, E.E.,  Au Alvarez, O.,  Artigas Fuentes, F.J., Valdés Díaz, B. (2017). **Experiencias en la mejora de desempeño de aplicaciones para el cálculo científico en el clúster HPC de la Universidad de Oriente**. SIGESTIC´17. 

Rodríguez Pérez, J., Castillo Alvarez, M., Rodríguez López, J.A. (2017). S**imulación de la hidrodinámica del mar en la costa norte de Ciego de Ávila durante el huracán Irma**. III Convención Internacional de Biogeociencias.

Artigas Fuentes, F.J. (2017). **HPC de la Universidad de Oriente. Interfaz de usuario**. Las TICs al servicio de la comunidad universitaria.

García Lorenzo, J. A. (2016).  **Técnicas de computación paralela en Matlab: Aplicación en la corrección de sombreado en imágenes de la membrana carioalantoica de embriones de pollos**. II Conferencia Internacional de Ciencias Técnicas.  

Arce-Molina, J. (2016).  **Loading-dependent diffusion of CO2 in PKU-9 zeolite monoporous system: a molecular dynamics simulation study**. Symposio Internacional de Química.

Au Alvarez, O. (2016). **HPC UO: 14 meses después**. Taller TP-1 VLIR.

Artigas Fuentes, F.J., Au, O. (2016). **Posibilidades del clúster de la Universidad de Oriente para su uso en las investigaciones**, III Taller de enseñanza de la Física.

Au Alvarez, O, Artigas Fuentes, F.J. (2015). **Recursos para la computación de alto rendimiento en la Universidad de Oriente**. III Taller de Integración de las TICs en Universidades Cubanas.
 
Au Alvarez, O. (2015). **Clúster para cálculos en paralelo en el Departamento de Química de la Universidad de Oriente**. I Taller de Software Libre en el Oriente Cubano.

===== Trabajos de Doctorados =====

Milanés Hermosilla, Daily (2022). **Arquitecturas de redes neuronales para la clasificación de tareas de imaginación motora**. Departamento de Ing. Automática, Facultad de Ing. Eléctrica. Universidad de Oriente. 

Rojas Vargas, Julio Alberto (2022). **Evaluación in vitro e in silico de la actividad antimicrobiana de imidazoles arilsustituidos sintetizados**. Departamento de Química, Facultad de Ciencias Naturales y Exactas. Universidad de Oriente. 

Rodríguez Aldana, Y. (2019). **Methods for nonconvulsive epileptic seizure monitoring**. CENPIS, Universidad de Oriente. 

===== Trabajos de Maestría =====
Mederos Nuñez, J. (2022). **Estimación del coeficiente de selectividad potenciométrico mediante parámetros químico-físicos calculados por Teoría del Funcional de la Densidad**. Universidad de Oriente. Tutores: Maria Arada y América García.

Valdés Díaz, B. (2020). **Herramientas computacionales para mejorar el proceso de interacción de los usuarios con el clúster de la Universidad de Oriente**. Universidad de Oriente. Tutor: Fernando Artigas Fuentes.

Lavadié González, C.E. (2020). **Estudios de inhibición in silico con enzimas diana de la ruta de biosíntesis de esteroles de Cryptococcus neoformans y Pneumocystis jirovecii**. Universidad de Oriente. 

===== Trabajos de Diploma =====

Beato Arias, C. (2020). **Implementación de un sistema de detección de intrusos para la seguridad lógica del Computador de Alto Rendimiento de la Universidad de Oriente**. Depto. de Telecomunicaciones, Universidad de Oriente.

Fernández Quintana, L.D. (2020). **Validación dosimétrica in silico de un modelo de equipo multidetector de Tomografía Computarizada**. Universidad de Oriente.

Domínguez Pérez, L.A. (2020). **Diseño de aplicación sobre plataforma móvil para la detección de latidos de origen ventricular**. Ing. Biomédica, Universidad de Oriente.

Azcanio Fuentes, L. (2020). **Estudios teóricos de acoplamiento molecular entre la enzima glucógeno sintasa 3 beta (GSK3β) y una serie heterogénea de compuestos como potenciales agentes anti-Alzheimer**. Depto. de Química, Universidad de Oriente.

Columbié, A.M. (2020). **Estudio teórico de pseudopéptidos imidazólicos frente a proteínas de Leishmania spp**. Depto. de Química,  Universidad de Oriente.

Rodríguez López, J.A. (2019). **Simulación de la marea astronómica, setup del oleaje y la surgencia de la tormenta en la costa norte de Ciego de Ávila durante el huracán Irma**. Universidad de Ciego de Ávila.

Bergues Morales, L. (2019). **Diseño y estudio teórico de una serie de compuestos con posible actividad antibacteriana contra Staphilococcus aureus**. Depto. de Química,  Universidad de Oriente.

Portales Navarro, E. (2019). **Estudio teórico de solubilidad y acoplamiento molecular de pseudopéptidos imidazólicos frente a proteínas de Leishmania spp**. Depto. de Química, Universidad de Oriente.

Castañeda Fis, S. de J. (2018). **Implementación de una interfaz gráfica para el procesamiento de imágenes de RMN con Redes Neuronales**. Ing. Biomédica, Universidad de Oriente.

Mejías Vaillant, J.Y. (2018). **Interfaz gráfica para la clasificación de imágenes de tumores cerebrales con la técnica Autoencoders**. Ing. Biomédica, Universidad de Oriente.

Hernández Váquez, O. (2017). **Simulación hidrodinámica y la surgencia de tormenta del huracán Charley en la costa norte de Ciego de Ávila**. Universidad de Ciego de Ávila.

Martínez Guerra, M. (2017). **Método para la clasificación de polaridad en tweets**. Depto. de Ciencias de la Computación, Universidad de Oriente.

Drullet Ferrer, J. (2017).  **Reconocimiento de niveles de anestesia en señales electro-encefalográficas usando Sistemas Neuro-difusores**. Ing. Biomédica, Universidad de Oriente.

Díaz Matos, A. (2017).  **Predicción de la evolución de comunidades en redes sociales**. Depto. de Ciencias de la Computación, Universidad de Oriente. 

Diéguez Pérez, R. (2017). **Determinación de propiedades electrónicas y mecánicas de óxidos de metales de transición: un estudio mecánico cuántico**. Instituto Superior Minero Metalúrgico.

Pérez Cuéllar, S.W. (2016).  **Codificación de alta eficiencia usando HPC para ser implementada en la TV digital de ultra alta definición en Cuba**.  (Los cálculos fueron realizados en los HPCs de la UCLV y la Universidad de Oriente). 

Traba Rosales, L. (2016).  **Clasificación del estado de sedación profunda en el canal electroencefalográfico F4 usando Redes Neuronales Artificiales**.  Ing. Biomédica, Universidad de Oriente.